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單細(xì)胞測(cè)序在腫瘤檢測(cè)中有哪些應(yīng)用?
單細(xì)胞測(cè)序在腫瘤檢測(cè)中有哪些應(yīng)用?
加入時(shí)間:2016-02-15 15:46:08 當(dāng)前新聞點(diǎn)擊率:3565
單細(xì)胞測(cè)序是指DNA研究中涉及測(cè)序單細(xì)胞微生物相對(duì)簡(jiǎn)單的基因組,更大更復(fù)雜的人類細(xì)胞基因組。隨著測(cè)序成本的大幅度下降,破譯來(lái)自單細(xì)胞的30億堿基的基因組并逐個(gè)細(xì)胞比較序列正在變?yōu)楝F(xiàn)實(shí)。目前,最常見(jiàn)的單細(xì)胞測(cè)序的應(yīng)用是在腫瘤研究上。來(lái)自美國(guó)和英國(guó)的研究人員近日利用單細(xì)胞基因組擴(kuò)增、測(cè)序和裝配,從海洋樣本中鑒定出一個(gè)單細(xì)胞細(xì)菌。 單細(xì)胞測(cè)序方法即single cell sequencing(SNS),能準(zhǔn)確定量一個(gè)單細(xì)胞核中基因拷貝數(shù)目。由于癌細(xì)胞中基因組部分被刪除,或者擴(kuò)增,從而引起關(guān)鍵基因的缺失,或者表達(dá)過(guò)量,干擾正常細(xì)胞生長(zhǎng),因此利用這種方法就能分析基因拷貝數(shù)目,從而診斷癌癥、腫瘤等。下圖這款是普東興全基因組擴(kuò)增試劑盒,優(yōu)化了等溫?cái)U(kuò)增的反應(yīng)體系,可以實(shí)現(xiàn)微量樣本全基因組的無(wú)差別擴(kuò)增,擴(kuò)增的產(chǎn)物大小在2-100kb之間,平均片段長(zhǎng)度大于20kb,廣泛適用于二代測(cè)序,大片段拷貝數(shù)變異分析,微衛(wèi)星分析,qPCR分析,基因芯片分析等。
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